房屋拆迁补偿协议是拆迁办与被拆迁人之间就补偿方式、金额、支付期限等事项达成的法律约定。若拆迁办在协议签订后扣留补偿款，其行为可能构成违法，需结合《国有土地上房屋征收与补偿条例》及相关法律法规进行分析。

一、协议的法律效力与履行义务

根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条，房屋征收部门与被征收人应就补偿事项订立协议，并严格按照协议约定履行义务。若拆迁办未按协议约定支付补偿款，则构成违约，被拆迁人有权要求其履行支付义务。例如，若协议约定补偿款应在搬迁后三十日内支付，而拆迁办逾期未支付，则被拆迁人可依法主张权利。

二、扣留补偿款的违法性分析

违反协议约定：拆迁办扣留补偿款的行为直接违反了协议约定的支付义务，构成违约。

损害被拆迁人权益：补偿款是被拆迁人因房屋征收而应得的财产权益，扣留行为可能导致被拆迁人无法及时获得补偿，影响其正常生活。

违反法律法规：根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》的规定，实施房屋征收应遵循“先补偿、后搬迁”的原则，任何单位和个人不得采取非法方式迫使被征收人搬迁。扣留补偿款的行为可能构成对这一原则的违反。

三、被拆迁人的维权途径

协商解决：被拆迁人可首先与拆迁办进行协商，要求其按照协议约定支付补偿款。在协商过程中，建议保留相关证据，如协议书、支付凭证等。

行政复议：若协商无果，被拆迁人可依法向作出房屋征收决定的市、县级人民政府申请行政复议，要求复议机关对拆迁办的扣留行为进行审查并作出决定。

行政诉讼：若对复议决定不服，或复议机关逾期未作出决定，被拆迁人可在法定期限内向人民法院提起行政诉讼，要求法院判决拆迁办履行支付义务。

四、法律责任与救济措施

民事责任：若拆迁办扣留补偿款的行为构成违约，被拆迁人可要求其承担违约责任，包括支付补偿款、赔偿因违约造成的损失等。

行政责任：若拆迁办的扣留行为违反了相关法律法规，相关部门可依法对其进行处罚，如责令改正、罚款等。

刑事责任：在极端情况下，若拆迁办的行为构成犯罪(如贪污、挪用公款等)，则可能依法追究其刑事责任。

五、实务建议与风险防范

签订协议前审查：被拆迁人在签订补偿协议前，应仔细审查协议条款，确保支付方式、期限等事项明确无误。

保留证据：在协议履行过程中，建议保留相关证据，如支付凭证、沟通记录等，以备后续维权之需。

及时维权：若发现拆迁办存在扣留补偿款等违约行为，被拆迁人应及时采取维权措施，避免因时效届满丧失胜诉权。

法律咨询：若对协议履行、维权途径等存在疑问，建议及时咨询专业律师，确保自身权益得到有效维护。